Ce processus d’auto-épuration est dû en grande partie à des organismes vivants (bactérie, algues) qui minéralisent la matière organique pour ensuite être assimilée par les végétaux supérieurs (macrophytes). Certains d’entre d’eux et principalement les roseaux permettent une oxygénation du milieu et favorisent ainsi le développement de micro-organismes aérobies.

Le lagunage naturel, les lits et filtres plantés de roseaux sont autant de techniques qui copient, reprennent et améliorent le fonctionnement d’une zone humide.